Das Medizinstudium beendete Frau Dr. med. Natalie Jägli 2011 mit dem eidgenössischen Staatsexamen an der Universität Bern. Danach absolvierte sie ihre Ausbildung zur Fachärztin für Gynäkologie und Geburtshilfe im Spital Grabs, im Kantonsspital St. Gallen, im Spital Heiden sowie in der Frauenarztpraxis Dr. Schmoll in Rorschach. Nach Erlangung des Facharzttitels arbeitete sie während mehreren Jahren als Oberärztin im Spital Grabs und zuletzt im Kantonsspital St. Gallen. Dort konnte sie ihre Fähigkeiten insbesondere im Gebiet der Pränatalmedizin (Ultraschall in der Schangerschaft, Betreuung von komplizierten Schwangerschaften) und Geburtshilfe vertiefen.
Seit Februar 2023 ist sie Teil des Praxisteams der Stadtpraxis für Frauen AG. Als Belegärztin an der Hirslanden Klinik Stephanshorn begleitet sie Geburten und führt gynäkologische Operationen durch.